在新药研发链条中,先导化合物(Lead Compound)是连接“苗头化合物发现”与“候选药物开发”的关键环节。一个优秀的先导化合物,不仅要有明确的生物活性,还需要具备良好的成药性、可修饰性和可放大性。然而,从苗头化合物到先导化合物,再到先导化合物优化(Lead Optimization),往往涉及大量的结构修饰、类似物合成、药代性质改善和工艺路线摸索。

西安瑞禧生物依托在有机合成、药物化学、生物偶联和功能分子领域的技术积累,面向科研院所、药企和生物技术公司,提供基于先导化合物的定制业务支持。那么,瑞禧生物具体可以定制先导化合物的哪些方面?以下从结构优化、官能团修饰、药代性质改善、手性控制、前药设计、偶联与连接子、类似物库构建、工艺放大及配套表征等维度进行说明。

 

一、先导化合物结构优化定制:从骨架到取代基的系统修饰

先导化合物优化通常围绕“活性—成药性”平衡展开。西安瑞禧生物可根据客户提供的先导化合物结构、活性数据和优化目标,进行系统的结构修饰与定制合成,包括:

⭕️骨架跃迁(Scaffold Hopping):在保持关键药效团的前提下,替换或改造核心骨架,改善专利空间、代谢稳定性或活性。

⭕️环系改造:开环、闭环、扩环、缩环,引入杂环或脂肪环,调节分子刚性和构象。

⭕️取代基优化:在芳香环、杂环或脂肪环上引入甲基、乙基、异丙基、环丙基、氨基、羟基、甲氧基、卤素等,系统研究构效关系。

⭕️生物电子等排替换:如用氟替换氢、用氧替换硫、用氮替换碳、用羧酸生物电子等排体替换羧基等,改善活性或代谢性质。

⭕️分子简化与剪裁:去除冗余结构,降低分子量,提高合成可及性和成药性。

⭕️多取代组合定制:针对同一骨架,定制一系列不同取代基组合的类似物,用于构效关系研究。

也就是说,客户不仅可以选择“改哪里”,还可以指定“改成什么”“改几个位置”“保留哪些药效团”。

 

二、官能团与药效团定制:精准调节活性与性质

先导化合物的活性往往依赖特定官能团和药效团。西安瑞禧生物可在先导化合物上引入、转化或保护多种官能团,包括:

⭕️常见官能团:氨基、羟基、羧基、醛基、酮基、酯基、酰胺基、磺酰胺基、脲基、胍基等;

⭕️卤素取代:F、Cl、Br、I,尤其是氟化修饰,用于提高代谢稳定性和脂溶性;

⭕️硼酸/硼酸酯:用于Suzuki偶联、硼酸类药物或前药设计;

⭕️叠氮、炔基、烯基、马来酰亚胺、巯基、NHS酯:用于生物偶联、点击化学和靶向递送;

⭕️保护基策略:Boc、Fmoc、Cbz、TBS、THP、乙酰基等,满足多步合成和后续脱保护需求;

⭕️药效团拼接:将不同活性片段拼接或融合,构建多靶点或双功能分子。

⭕️客户可以指定官能团类型、取代位置、数量和连接方式,瑞禧生物据此设计合成路线。

官能团与药效团定制

三、药代动力学性质改善定制:让先导化合物更“成药”

先导化合物即使活性很好,也可能因为代谢快、溶解度差、渗透性低或毒性高而无法推进。西安瑞禧生物可围绕药代性质进行定制优化,包括:

⭕️代谢稳定性优化:通过氟化、氘代、环化、位阻保护等策略,阻断或延缓代谢位点;

⭕️溶解度改善:引入亲水基团、可电离基团、PEG链或前药策略;

⭕️渗透性调节:调节分子极性、分子量和氢键供受体数量;

⭕️半衰期延长:通过结构修饰、PEG化、脂肪酸链修饰等延长体内循环时间;

⭕️毒性降低:规避毒性警示结构,优化代谢产物谱;

⭕️口服生物利用度改善:综合优化溶解度、渗透性和代谢稳定性。

这类定制通常需要与客户的药代、药理数据联动,瑞禧生物可根据反馈进行迭代合成和优化。

药代动力学性质改善定制

 

四、手性先导化合物定制:单一对映体与手性中心控制

许多先导化合物的活性、代谢和毒性具有立体选择性。西安瑞禧生物可提供:

⭕️单一对映体定制:通过不对称合成、手性催化或手性拆分获得目标对映体;

⭕️手性中心引入:在指定位置构建一个或多个手性中心;

⭕️非对映异构体定制:合成特定非对映异构体,用于立体构效关系研究;

⭕️手性纯度控制:提供ee值或de值可控的产品,通常可达ee≥99%;

⭕️手性分析:手性HPLC、旋光度、NMR等表征;

⭕️消旋体拆分:对已有消旋先导化合物进行手性拆分。

这对于手性药物、神经类药物和酶抑制剂等项目尤为重要。

 

五、前药与软药设计定制:改善递送与代谢

前药策略是改善先导化合物成药性的常用手段。西安瑞禧生物可提供:

⭕️酯类前药:提高口服吸收或延长作用时间;

⭕️酰胺类前药:改善溶解度和靶向性;

⭕️磷酸酯/膦酸酯前药:提高水溶性,适用于抗病毒和抗癌药物;

⭕️糖苷前药:利用糖转运体提高靶向性;

⭕️肽段前药:利用肽酶特异性释放;

⭕️可裂解连接子前药:在特定酶或pH条件下释放活性药物;

⭕️软药设计:设计代谢后可快速失活的类似物,降低系统毒性。

客户可以指定前药类型、释放机制和连接方式,瑞禧生物负责合成与验证。

 

六、偶联与连接子定制:服务ADC、PROTAC、分子探针等

先导化合物常需要通过连接子与靶向配体、E3配体、荧光染料或抗体偶联。西安瑞禧生物可提供:

⭕️Linker定制:PEG linker、烷基链、肽 linker、可裂解/不可裂解 linker;

⭕️偶联位点引入:马来酰亚胺、NHS酯、叠氮、DBCO、TCO、四嗪等;

⭕️ADC相关定制:将先导化合物与抗体偶联位点、可裂解连接子结合;

⭕️PROTAC相关定制:将先导化合物与E3配体通过linker连接,构建降解剂;

⭕️荧光探针定制:将先导化合物与荧光素、罗丹明、Cy、BODIPY等偶联;

⭕️双功能分子定制:将两个先导化合物或药效团连接,构建双靶点分子。

这类定制不仅合成分子,还围绕下游应用提供偶联方案支持。

偶联与连接子定制

七、先导化合物类似物库定制:支持构效关系与高通量筛选

先导化合物优化往往需要大量类似物。西安瑞禧生物可根据客户需求,设计并合成:

⭕️取代基类似物库:同一骨架,不同取代基组合;

⭕️骨架类似物库:不同核心骨架,相同药效团;

⭕️手性类似物库:不同立体构型;

⭕️前药类似物库:不同前药策略;

⭕️偶联类似物库:不同linker和靶头组合;

⭕️多样性导向合成库:基于先导化合物构建结构多样的小分子库。

规模可从几十个到几百个化合物,纯度≥95%,适合高通量筛选和构效关系研究。

 

八、先导化合物工艺优化与放大定制:从毫克到公斤级

先导化合物名远终需要可放大、可重复的合成工艺。西安瑞禧生物可提供:

⭕️路线设计与优化:提高收率、降低杂质、减少危险试剂、优化成本;

⭕️工艺放大:从毫克级、克级到公斤级;

⭕️关键中间体定制:提供路线中的关键中间体,缩短客户研发周期;

⭕️晶型与盐型筛选:改善溶解度、稳定性和加工性;

⭕️杂质控制:对特定杂质进行定性、定量和限度控制;

⭕️批次一致性:保证不同批次间质量稳定,适合长期项目。

这对于临床前研究和早期临床样品制备尤为重要。

先导化合物工艺优化与放大定制 

九、表征、检测与配套服务定制

西安瑞禧生物在提供先导化合物定制合成的同时,还可提供完整的配套支持:

⭕️结构确证:NMR、LC-MS、HPLC、GC、XRD、手性HPLC、元素分析等;

⭕️纯度检测:HPLC、GC、手性纯度、残留溶剂等;

⭕️稳定性研究:光照、温度、湿度、氧化稳定性;

⭕️储存与包装定制:避光、低温、干燥、惰性气体保护,分装规格灵活;

⭕️COA与MSDS:随货提供质检报告和安全数据表;

⭕️保密与IP保护:支持CDA/NDA合作,保护客户结构和知识产权。

 先导化合物表征、检测与配套服务定制

十、先导化合物定制相关案例梳理

⭕️PROTAC / 靶向降解剂:从小分子配体到双功能降解分子

⭕️案例方向:小分子 PROTAC 化合物定制合成

⭕️输入:客户给定 E3 连接酶配体(如泊马度胺/来那度胺衍生物)+ 靶点配体(激酶/表观遗传蛋白/核受体)

⭕️瑞禧动作:

    设计 Linker 长度(PEG / alkyl / 刚性芳环)

    筛选连接位点(N 端、羧基、羟基、叔胺)

⭕️合成中间体:活性酯 PEG、alkyl bromide、DBCO、NHS、Mal

⭕️组装 POI–linker–E3 三元分子

⭕️提供 NMR / MS / HPLC 确证

⭕️产出:mg–g 级 PROTAC 先导分子,用于细胞降解验证

⭕️对应公开服务:小分子 PROTAC 化合物定制合成|靶点特异性蛋白降解剂研发一站式解决方案

科研价值:把“两个已知小分子”变成“可降解靶蛋白的先导分子”,适合高校药化组做 SAR / 降解效率筛选。

 

十一、相关文献资料

1.Bleicher KH, Böhm HJ, Müller K, Alanine AI. Hit and lead generation: beyond high-throughput screening. Nature Reviews Drug Discovery. 2003;2:369–378.

2.Hajduk PJ, Greer J. A decade of fragment-based drug design: strategic advances and lessons learned. Nature Reviews Drug Discovery. 2007;6:211–219.

3.Fattori D, Squarcia A, Bartoli S. Fragment-based approach to drug lead discovery: overview and advances in various techniques. Drugs in R&D. 2008;9(4):217–227.

4.Caldwell GW, Yan Z, Tang W, Dasgupta M, Hasting B. ADME optimization and toxicity assessment in early- and late-phase drug discovery. Current Topics in Medicinal Chemistry. 2009;9(11):965–980. DOI: 10.2174/156802609789630929.

5.Gleeson MP, Montanari D. Strategies for the generation, validation and application of in silico ADMET models in lead generation and optimization. Expert Opinion on Drug Metabolism & Toxicology. 2012;8(11):1435–1446. DOI: 10.1517/17425255.2012.711317.

6.Erlanson DA, Fesik SW, Hubbard RE, Jahnke W, Jhoti H. Twenty years on: the impact of fragments on drug discovery. Nature Reviews Drug Discovery. 2016;15:605–619.

7.OptADMET: a web-based tool for substructure modifications to improve ADMET properties of lead compounds. Nature Protocols. 2024. DOI: 10.1038/s41596-023-00942-4.

 

十二、先导化合物定制能力一览表

定制维度

具体内容

典型应用

结构优化

骨架跃迁、环系改造、取代基优化、生物电子等排

构效关系、专利空间

官能团

氨基、羧基、卤素、硼酸、叠氮、炔基等

活性调节、偶联

药代性质

代谢稳定性、溶解度、渗透性、半衰期

成药性优化

手性

单一对映体、手性中心、ee≥99%

手性药物

前药

酯、酰胺、磷酸酯、糖苷、肽段前药

递送与代谢改善

偶联连接

PEG、肽、可裂解linker、点击化学

ADC、PROTAC、探针

类似物库

取代基库、骨架库、手性库、前药库

高通量筛选

工艺放大

路线优化、克级到公斤级、晶型盐型

临床前研究

配套服务

表征、纯度、稳定性、COA、保密

一站式支持